| 李诗良 研究员 |
工作单位：华东师范大学药学院、人工智能新药创智中心 职称、职务：研究员 邮箱：slli@hsc.ecnu.edu.cn |
个人简介：
李诗良，华东师范大学人工智能新药创智中心研究员，紫江青年学者，博士生导师，上海市青年科技启明星。长期围绕靶标识别与发现，以多源生物医药资料、多维组学数据、多样分子结构特征等作为数据和信息来源，系统研究深度学习等不同计算方法和技术路径在挖掘药物靶标、识别药物结合位点中的可行性，并发现新靶标、新位点和原创新药。共发表SCI论文62篇，其中以独立/共同第一或通讯作者在Nat. Mach. Intell., PNAS, Signal Transduct. Target. Ther., Protein & Cell, APSB, Briefings Bioinf.,J. Med. Chem.等发表SCI论文33篇；申请发明专利18项，转国际PCT专利6项，获中国授权9项，国外授权14项；获软件版权5项；在靶标识别和确证过程中，发现若干新型强效的候选药物，现已有2个治疗病毒感染、糖尿病的候选药物完成技术成果转化，1个进入临床研究；主持国家、省部级科研项目7项，包括国家自然科学基金面上和青年项目、国家重点研发计划子课题等；获第二十二届工博会高校展区特等奖、第十五届中国药学会青年药学论坛优秀论文一等奖等荣誉；担任BMC Bioinformatics编委，兼任中国药学会药物化学专业委员会青年委员、上海市药学会人工智能药学专业委员会委员、上海市药学会海洋药物专业委员会委员、上海市药学会药理学专业委员会青年委员。
学习经历：
1) 2011-09至2016-06，华东理工大学，药学，博士（导师：李洪林教授）
2) 2007-09至2011-06，华东理工大学，制药工程，学士
工作经历：
1) 2023至今，华东师范大学药学院，人工智能新药创智中心，研究员2) 2019-08至2022-12，华东理工大学，药学院，副教授
3) 2018-11至2019-07，华东理工大学，药学院，特聘副研究员
4) 2016-07至2018-10，华东理工大学，博士后（合作导师：徐玉芳教授）
荣誉及奖励：
上海市“科技创新行动计划”启明星（2023）
第十五届中国药学会青年药学论坛优秀论文一等奖（2020）
第二十二届工博会高校展区特等奖（2020）
上海市青年科技英才“扬帆”计划（2018）
上海市高等学校优秀博士毕业生（2016）
第十二届“挑战杯”全国二等奖（2011）
研究方向：
1.人工智能药物设计方法开发与应用
2.药学知识图谱构建
3.代谢性疾病新药发现
发表论文：
1.Shiliang Li#, Fang Ye#, Yucheng Zheng#, Jie Wang#, Haoran Peng#, Lili Zhu, Lili Chen, Tao Yu, Huan Ge, Jiaqi He, Binghao Zhang, Jiayun Wu, Zhiyi Zhang, Liangliang Jiang, Geng Chen, Ping Zhao, Ke Lan, Zhenjiang Zhao, Xuhong Qian, Ke Xu*, Yang Du*, Honglin Li*. Dual-Locking the SARS-CoV-2 Spike Trimer: An Amphipathic Molecular “Bolt” Stabilizes Conserved Druggable Interfaces for Coronavirus Inhibition. Advanced Science, DOI: 10.1002/advs.202417534 (2025).
2.Shiliang Li#, Weijia Sun#, Shuang Li#, Lili Zhu, Shuai Guo, Jiaqi He, Yuheng Li, Chaoquan Tian, Zhenjiang Zhao, Tao Yu, Jianwei Li, Yiqing Zhang, Youlong Hai, Jiawen Wang, Yongjun Zheng, Rui Wang, Xiaoyong Hu, Shukuan Ling*, Honglin Li*, Yingxian Li*. Tamsulosin ameliorates bone loss by inhibiting the release of Cl− through wedging into an allosteric site of TMEM16A. Proc. Natl. Acad. Sci., 2025. 122(1) : e2407493121.
3.Ziyan Feng, Jingyang Chen, Youlong Hai, Xuelian Pang, Kun Zheng, Chenglong Xie, Xiujuan Zhang, Shengqing Li, Chengjuan Zhang, Kangdong Liu, Lili Zhu, Xiaoyong Hu*, Shiliang Li*, Jie Zhang*, Kai Zhang*, Honglin Li*. Sliding-attention transformer neural architecture for predicting T cell receptor–antigen–human leucocyte antigen binding. Nat. Mach. Intell., 2024. 6 : 1216–1230.
4.Jinxin Xie, Shanshan Ruan, Mingyan Tu, Zhen Yuan, Jianguo Hu, Honglin Li*, Shiliang Li*. Clustering single-cell RNA sequencing data via iterative smoothing and self-supervised discriminative embedding. Oncogene, 2024. 43 : 2279–2292.
5.Ziyan Feng, Zihao Shen, Honglin Li, Shiliang Li*. e-TSN: an interactive visual exploration platform for target-disease knowledge mapping from literature. Briefings Bioinf., 2022. 23(6) : bbac465.
6.Thian-Sze Wong#, Guangzhi Li#, Shiliang Li#, Wei Gao, Geng Chen, Shiyi Gan, Manzhan Zhang, Honglin Li*, Song Wu*, Yang Du*. G protein-coupled receptors in neurodegenerative diseases and psychiatric disorders. Signal Transduction Targeted Ther., 2023. 8 : 177.
7.Rui Xiong#, Leike Zhang#, Shiliang Li#, Yuan Sun, Minyi Ding, Yong Wang, Yongliang Zhao, Yan Wu, Weijuan Shang, Xiaming Jiang, Jiwei Shan, Zihao Shen, Yi Tong, Liuxin Xu, Yu Chen, Yingle Liu, Gang Zou, Dimitri Lavillete, Zhenjiang Zhao,Rui Wang, Lili Zhu, Gengfu Xiao, Ke Lan, Honglin Li*, Ke Xu*. Noveland potent inhibitors targeting DHODH are broad-spectrum antivirals against RNA viruses including newly-emerged coronavirus SARS-CoV-2.Protein&Cell, 2020. 11: 723–739.
8.Fanxun Zeng#, Shiliang Li#, Guantian Yang#, Yating Luo#, Tiantian Qi, Yingfan Liang, Tingyuan Yang, Letian Zhang, Rui Wang*, Lili Zhu*, Honglin Li*, Xiaoyong Xu*. Design, synthesis, molecular modeling, and biological evaluation of acrylamide derivatives as potent inhibitors of human dihydroorotate dehydrogenaseforthetreatmentofrheumatoidarthritis.Acta Pharm.Sin.B.2021. 11(3): 795-809.
9.Shiliang Li#, Chun Qin#, Shichao Cu#, Hongling Xu, Fangshu Wu, Jiawei Wang, MingboSu,XiaoyuFang,DanLi,QianJiao,MingZhang,ChunmeiXia,LiliZhu, Rui Wang, Jia Li, Hualiang Jiang, Zhenjiang Zhao*, Jing-Ya Li*, Honglin Li*. Discovery of a natural-product-derived preclinical candidate foronce-weekly treatment of type 2 diabetes. J. Med. Chem. 2019. 62(5): 2348-2361.
10.Shiliang Li#, Hongling Xu#, Shichao Cui#, Fangshu Wu#, Youli Zhang, Mingbo Su, Yinghui Gong, Shaobing Qiu, Qian Jiao, Chun Qin, Jiwei Shan, Ming Zhang, Jiawei Wang, Qiao Yin, Minghao Xu, Xiaofeng Liu, Rui Wang, Lili Zhu, Jia Li, Yufang Xu, Hualiang Jiang, Zhenjiang Zhao*, Jingya Li*, Honglin Li*. Discovery and rational design of natural product-derived 2-phenyl-3,4-dihydro-2H-benzo[f]chromen-3-amine analogs as novel and potent DPP-4 inhibitors for the treatment of type 2 diabetes. J. Med. Chem.2016,59 (14), 6772-6790.
主持科研项目：
上海市科委，“科技创新行动计划”启明星项目，“AI药物代谢动力学计算方法开发及应用研究”，23QA1402800，2023-03至2026-02，在研，主持
国家自然科学基金委员会，面上项目，“靶向RSK4的新型抗食管鳞状细胞癌抑制剂的设计、合成与生物活性研究”，82173690，2022-01至2025-12，在研，主持
国家重点研发计划子课题，“基于AI的蛋白质-小分子结合动力学及药物设计新方法研究”，2022YFC3400504，2022-11至2027-10，在研，主持
临港实验室，“求索杰出青年计划”开放课题，“基于人工智能的药物代谢和通路的计算方法开发与应用”，LG-QS-202206-02，2022-01至2024-12，在研，主持
国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，“基于蛋白质功能位点相似性的药物重定位新方法的开发及应用”，81803437，2019-01至2021-12，结题，主持
上海市科委，青年科技英才扬帆计划，“锁定蛋白质机器的药物重定位新方法的开发及应用”，18YF1405100，2018-05至2021-04，结题，主持
中国博士后科学基金会，面上一等资助，“基于结合动力学的新型DHODH抑制剂的设计及优化”，2016M600290，2016-11至2018-07，结题，主持
指导学生获奖：
2021.08，指导第七届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛上海赛区银奖，授予单位：上海市教育委员会
2021.07，指导第十四届中国大学生计算机设计大赛二等奖；授予单位：中国大学生计算机设计大赛组织委员会
2021.05，指导第十三届上海市大学生计算机应用能力大赛一等奖；授予单位：上海市教育委员会
2019.05，指导第十六届“挑战杯”上海市大学生课外学术科技作品竞赛三等奖；授予单位：上海市科学技术委员会
招生专业：
1. 药学学术博士、硕士（药物设计、人工智能）
2. 生物与医药工程博士、硕士（制药工程）
设会兼职：
•中国药学会高级会员
•中国化学会高级会员
•上海市药学会会员
•中国药学会药物化学专业委员会青年委员
•上海市药学会人工智能药学专业委员会委员
•上海市药学会海洋药物专业委员会委员
•上海市药学会药理学专业委员会青年委员
•担任BMC Bioinformatics编委
•担任J. Med. Chem.、J. Chem. Inf. Model.、Briefings Bioinf.、APSB等专业期刊审稿人
